仪器使用

中科院生物物理研究所生物成像中心数据采集与存储系统管理办法

发布时间:2021-10-31

  为了充分发挥金沙集团1862cc生物成像中心(以下简称“成像中心”)数据采集与存储系统(以下简称“数据系统”)服务科研的效用,特制定此管理办法。

  一、用户管理

  1.“数据系统”是专为采集和存储“成像中心”的大型仪器运行所产生的数据而构建的,因此,“数据系统”的用户也是“成像中心”的注册用户。要成为注册用户,必须向“系统”管理员提出开户申请,填写开户申请表,承诺接受本“管理办法”的相关条件,并获得“成像中心”负责人批准。

  2. “用户组”的概念:每个用户都属于一个特定的“用户组”(比如一个研究组),一个“用户组”可以有1个或多个成员(比如同个研究组的多名成员)。

  3. 我们的“成像中心”加盟了北京生命科学大型仪器区域中心(以下简称“区域中心”),所以本“数据系统”首先满足“区域中心”用户的需求,此外,也积极为其他单位符合条件的用户提供服务。也因此,我们将“数据系统”的用户分为3类,即“区域中心内用户”,“区域中心外用户”,和“商业用户”,在收费的标准方面有所区别(详见以下的“收费方案”)。

  4. “数据系统”不提供与“成像中心”工作无关的服务。

  5. 在相关项目完成或阶段总结后,用户有义务向“中心”提交研究成果报告或项目总结报告(包括获奖证明)进行存档,发表文章和成果时须注明相关的工作在计本中心完成。

  6. 对不遵守相关规定的用户,“成像中心”可根据情节轻重责令其限期改正、给予警告、直至停止向其提供服务。如有严重违规或违法者,将根据国家相应的法律规定进行追究。

  二、 收费方案

  收费时以“用户组”为对象,费用主要由开户费、磁盘占用费、机时费三部分构成,细则如下:

  开户费:

  “区域中心内用户”,200 元/每用户组每月,超过两个用户的用户组,每增加一个用户加收20元/月。

  “区域中心外用户”,400 元/每用户组每月,超过两个用户的用户组,每增加一个用户加收50元/月。

  商业用户,800 元/每用户组每月,超过两个用户的用户组,每增加一个用户加收100元/月。

  磁盘占用费:

  指的是数据驻留于数据储存服务器EMDATA1(挂载为/leginon)和EMDATA2(挂载为/public)上所产生的费用,用户在自己家目录”/home/user-name”下的磁盘占用(设定为每个用户不超过10 G)不收取磁盘占用费。

  因为用户多而磁盘空间有限,我们要求“用户组”根据自己的实际需求申请磁盘配额,若用户组的总数据量超过了所申请的配额,可能会造成数据无法存储和读写的后果。

  收费时,我们将磁盘占用费分解成“配额费”和“实际占用费”两部分,配额部分保证用户组有足够的属于自己的磁盘空间,实际占用部分促使用户组尽量节省磁盘占用,细则如下:

  “区域中心内用户”组,配额费为 40元/(T.月),实际占用费为60元/(T.月);

  “区域中心外用户”组,配额费为 60元/(T.月),实际占用费为90元/(T.月);

  “商业用户”组,配额费为 80元/(T.月),实际占用费为120元/(T.月);

  比如,一个“区域中心内用户”组,申请配额2.5 T,实际占用情况是第一个月2 T,第二个月 1 T,第三个月 1.5 T,则这三个月的磁盘占用费为:2.5*40*3 + 60*(2+1+1.5) = 300 + 270 = 570 元

  机时费:

  指的是利用“系统”的小型计算机集群emcluster 对生物成像数据进行相关计算所产生的费用。目前,这种计算服务只对中科院生物物理所的用户开放,其他用户若需要(任何类别的)计算服务,请向本所的“高性能计算中心”提出申请。

  收费的大原则是鼓励大规模计算和并行计算,具体按以下3条标准执行:

  1.一般作业“1元/核·天”,并行作业(每个作业至少使用12个核)“0.9元/核/天”

  2.一个作业完成后费用不足0.1元的,按0.1元收费;

  3.结账时先按上2条述标准计算,如果总机时费超过2万,则按如下公式计算:2+ (2万以上4万以下部分)*0.8 + (4万以上部分)*0.6

  比如,上述两条标准算下来总机时费为5万元,则实际收费为:2 + 2*0.8 + 1*0.6 = 4.2 万元。

  三、条例的解释和更改权

  在“数据系统”运行的过程中,若发现上述条例有不当之处,在执行完和用户开户时的约定后,“成像中心”有权更改。

  条例的解释权归生物成像中心所有。

  中科院生物物理研究所生物成像中心

  2012-11-27

 


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