生物成像中心2014年度常规技术培训顺利完成
2014年9月,北京生命科学大型仪器区域中心年度常规仪器技术培训如期举办,该培训为北京生命科学大型仪器区域中心面向用户,主要就区域中心仪器设备的基本原理 、常规实验方法、基 本操作流程和操作安全规范展开培训,其中科学研究平台生物成像中心承担培训课程五项,包括:电子显微成像技术,原子力显微成像技术,激光共聚焦显微成像技术,结构照明超分辨荧光显微成像技术以及高性能计算机集群应用培训。
本次常规培训的主要内容有:
一,电子显微成像技术生物成像中心现已配有透射电子显微镜三台(120kV热发射透射电子显微镜FEI Tecnai Spirit, 200kV 热发射透射电子显微镜FEI Tecnai 20和先进的300kV 场发射低温透射电子显微镜FEI Titan Krios),双束扫描电子显微镜一台(FEI Helios Nanolab 600i, 配备了Quaroum PT3000低温样品载台),围绕这些显微设备,生物成像中心还配备了完整的用于生物超微结构研究的样品制备系统。本年度电子显微成像技术常规培训主要样品制备技术和电镜技术应用,其中样品制备技术培训内容包括:常规超薄切片样品制备技术,碳支持膜制备及样品负染色技术;电镜技术应用培训内容包括:透射电镜基本原理及应用(初级),透射电镜电子光学及合轴方法(中级)以及双束扫描电镜的基本原理及应用。此外,今年还新增了一体式光电关联显微镜iCorr的应用培训内容。iCorr是一款可搭建在FEI Tecnai系列电镜上的光学插件,可通过将电镜样品杆倾转90度实现488nm/525nm绿色荧光成像,以及反射光(明场)成像, 从而完成原位光电关联成像。iCorr配备一个15倍长工作距离光学镜头,其光学分辨率可达500nm。
图1.电子显微成像技术培训现场照片
二,原子力显微成像技术原子力显微镜(AFM)是扫描探针显微镜的一种,能以空前的高分辨率探测原子和分子的形状,并能确定物体的机械特性,除了能在空气中操作外,AFM也能够在液体中操作,因此能在接近生理条件的水合缓冲液中成像生物分子。AFM是第一个,目前也是唯一能在近似生理条件下对生物样品成像达到纳米分辨率的检测技术。本次常规培训讲座由生物成像中心贾艳侠老师负责,培训讲座主要内容包括原子力显微镜的基本原理以及原子力显微镜的优势及在生物学中的应用。随后的实习时间为学员演示了以下原子力显微镜成像的样品制备技术以及原子力显微镜的使用方法。
图2.原子力显微成像技术培训现场照片
三,激光共聚焦显微成像技术生物成像中心荧光成像小组现配备有全内反射荧光(TIRF)显微镜一台,激光扫描共聚焦显微镜两台( FV500, FV1000),转盘共聚焦显微镜一台(3I Marianas XL),双光子显微镜一台(FV1000MPE),本次激光共聚焦显微成像技术培训由滕岩老师主讲,内容包括:细胞荧光样品制备中常用荧光探针及其标记方法;荧光显微镜,共聚焦显微镜仪器的原理及应用;生物荧光样品图像的采集技术。学员上机实习内容包括:宽场荧光显微镜的使用,以及激光扫描共聚焦显微镜的使用。
四,结构照明超分辨荧光显微成像技术结构照明超分辨荧光显微镜Delta Vision OMX于2012年8月正式开始对外服务,该仪器是基于SD-SIM ( Three-Dimensional Structured Illumination Microscopy )的超分辨率荧光显微镜,突破了传统光学显微镜的分辨极限,侧向分辨率提高到80-120nm,纵向分辨率提高到300nm,十分有利于观察细胞内器官等细微结构的精确定位和分布。本次结构照明超分辨荧光显微成像技术培训讲座由李硕果老师负责,讲座中主要介绍了结构照明成像原理以及结构照明成像样品制备方法与注意事项,随后的上机实习为学员演示了OMX成像系统的操作步骤、要点及实验室管理注意事项。
图4.结构照明超分辨荧光显微成像技术培训现场照片
五,高性能计算机集群培训金沙集团1862cc生物物理所筹建的高性能计算中心主要是为了满足本研究所科研活动中日益增长的高性能计算需求,包括:透射电镜的数据收集、数据初步处理、三维重构,质谱原始数据的处理,晶体结构解析,分子动力学,分子建模,结构预测,以及其他生物信息学相关的大规模计算等等。计算中心现已加入中科院超级计算网格环境,在首先满足本所需求的前提下,也为所外的用户提供服务。本次常规培训由凌伦奖老师及丁玮老师负责,主要内容包括:主力机群浪潮TS10K的架构简介;规章制度及收费办法;高性能计算机集群浪潮TS10K的使用方法及联机实习。
图5.高性能计算集群培训现场照片