“生物物理所-徕卡”博士后出站报告会
2016年7月18日,2014年6月17日,应生物物理所生物成像中心主任孙飞研究员的邀请,北京生命科学研究所董梦秋研究员、中科院自动化所韩华研究员、生物物理所徐伟教授、王晓群研究员、季刚老师以及Leica公司生命科学部全国市场经理胡向东经理等人参加了在成像中心会议室举行的“生物物理所-Leica”博士后李喜霞有关《一种高通量大尺度生物样品三维重构新方法研究》的出站报告会。
报告中,李喜霞博士首先简要介绍了目前体电子显微学发展的现状,比较了现有的三种基于扫描电镜的体电子显微学(FIB-SEM、SBF-SEM、ATUM-SEM)重构策略的优缺点。提出了选取秀丽隐杆线虫作为研究对象,完善发展以自行研制的连续切片自动化收集装置和扫描电镜自动化成像为核心技术的高通量大尺度生物样品高分辨率三维重构方法(AutoCUTS-SEM),并建立一套一套完整的线虫三维结构数据库的课题研究目标。
随后,李喜霞博士重点讲述了AutoCUTS-SEM这种方法建立的四个主要环节:(1)适合于连续切片自动收集的扫描电镜样品制备的研究;(2)稳定实现高通量连续切片自动化收集;(3)高通量扫描电镜自动化成像的实现;(4)大尺度图像处理及三维重构分析;以及在方法建立过程中解决的关键问题。
最后,总结整个课题通过该方法共收集19条线虫连续切片;建立9个完整的线虫切片库;获得2套完整的线虫三维结构数据库。该完整线虫三维结构数据库,将更有利于人们用线虫这种模式生物揭示有关细胞凋亡、细胞分化、个体发育、衰老等方面的分子机制。
报告结束后,与会人员进行了热烈的讨论,大家纷纷对李喜霞博士在这两年做出的成果给予充分肯定,对AutoCUTS-SEM这种新方法充满兴趣,也非常希望可以将该方法真正地应用到解决具体的科学问题上。同时与会专家们也提到,随着生命科学研究的深入与大尺度数据需求的增加,这种新型大尺度三维重构方法今后将机遇与挑战并存,需要相关从业工作者不断在工作中创新突破,进一步寻找解决方案。