综合处

　　主要负责所务管理（包括所领导会议服务，综合协调，综合规划，政策研究与制度建设，重要文稿起草，公文管理，印章管理，综合统计，信息宣传，科学普及……

党群工作部

　　主要负责党务管理（包括党委会议服务，党的政治、思想、组织、宣传、统战工作，党风廉政建设等）、纪检监督审计管理（包括纪委会议服务、纪检、行政监督、内部审计等）……

科学技术处

　　主要负责科技规划与布局，基地建设，科技项目、经费、绩效管理，国内外学术交流与科技合作，知识产权开发与管理，成果转化，科研条件建设，保密管理，经营性国有资产管理……

人事处

　　主要负责机构、编制和岗位管理，公开招聘和竞聘上岗、人员聘用、考核和培训、奖励和处分管理，薪酬福利和社会保险管理，人才引进与培养，干部管理……

教育处

　　主要负责研究所学科建设，招生、学籍、培养、毕业、学位管理，教师管理，留学生管理，国科大生命科学学院教学管理、师资队伍建设、学生培养、科研学术管理……

资产财务处

　　主要负责研究所固定资产和无形资产管理、财务预算、成本管理、核算与决算、资金管理与调控、风险控制、专项财务等，以及所领导交办的工作。

学术支撑部

　　主要负责研究所网站、网络管理与服务、图书文献情报服务；《生物物理学报》《生物化学与生物物理进展》和《Protein & Cell》期刊的编辑和管理工作……