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2016年科研进展

snRNP组装机制的重要研究成果许瑞明研究组发表RNA剪接复合体核心组分

发布时间:2016年11月22日

  2016年11月10日,Genes & Development杂志在线发表了金沙集团1862cc许瑞明研究组关于剪接复合体核心组分snRNP组装机制的研究进展,文章题为:“Structural basis for snRNA recognition by the double-WD40 repeat domain of Gemin5”。

  前体mRNA剪接是一个高度动态的复杂过程,随着剪接反应的进程剪接体复合物随之重组和解离。剪接体组装的基石是5种富含尿嘧啶的小核核糖核酸-蛋白质复合物(U1,U2,U4/ U6和U5 snRNP),它们的核心分别由各自的小核RNA (snRNA)以及结合在其保守Sm序列上的七个不同Sm蛋白所组成。snRNP的正确组装是RNA剪接复合体形成的必要前题,然而其中的分子机制并不清楚。

  在体内,snRNP的组装需要SMN复合物的参与。SMN复合物中的SMN和Gemin2结合Sm蛋白,Gemin5结合snRNA。目前关于后者的机制认识缺乏,揭示Gemin5与snRNA的作用方式和识别特征,对于全面了解SMN复合物介导snRNP组装的分子机制具有重要意义。

  许瑞明研究组通过体外生化实验确定了Gemin5与U4 snRNA的结合区域,并解析了1.9 ?分辨率的Gemin5蛋白N端与snRNA底物的复合物晶体结构。结构显示,Gemin5蛋白N端形成双7叶β-螺旋桨状WD40结构域,横跨这两个WD40顶端的连续的碱性区域结合了U4 snRNA中Sm序列的前六个碱基。研究还发现紧邻Sm序列5’端的一个腺嘌呤对于蛋白的结合也起到重要作用。针对相关氨基酸残基和碱基的一系列定点突变实验结果验证了Gemin5与snRNA之间的序列特异性结合模式,并提示了介导两者相互作用的关键因素。

  由于WD40结构域是近年来鉴定的新型RNA结合蛋白,因此这项工作的另一个重要意义在于首次揭示了串联WD40结构域RNA之间直接的相互作用方式。

  本项工作由国家自然科学基金、北京市自然科学基金、金沙集团1862cc战略先导专项基金(B类)资助完成。许瑞明研究组的助理研究员金文星、博士生王奕、副研究员刘超培为文章的共同第一作者。许瑞明研究员和王明珠副研究员为本文的共同通讯作者。

  文章链接

  

  图示:Gemin5蛋白N端WD40结构域与U4 snRNA的复合物晶体结构。(A) Gemin5与包含Sm基序的短区域相结合。(B) Gemin5蛋白的双WD40结构域识别Sm基序及其5’端A碱基。(C) SMN复合物介导snRNP组装的分子模型。

 

(供稿:许瑞明课题组)

 

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