2017年6月27日，Nucleic Acids Research杂志在线发表了金沙集团1862cc王艳丽课题组及其合作者关于细菌Argonaute（Ago）蛋白引导链与靶链不完全互补配对的最新研究成果，题为“Structure/cleavage-based insights into helical perturbations at bulge sites within T. thermophilus Argonaute silencing complexes”。

　　RNA干扰对基因的表达调控具有重要作用，并且在生物中普遍存在。 Ago蛋白是RNA诱导的沉默复合体的核心组分，它能够利用microRNA作为引导链靶向完全或不完全互补配对的mRNA分子，从而降解目的mRNA或者抑制目的mRNA的翻译。王艳丽研究员的团队过去对于引导链－靶链完全互补配对的干扰机制进行了深入研究，但大多数的miRNA与靶链之间不能完全地互补，形成了很多突起或者错配。如此引发一些新的科学问题，例如，不同位点的突起和错配对向导链－靶链所形成的双螺旋产生什么样的影响？Ago蛋白如何容纳这些突起和错配？这些突起和错配对Ago活性的影响？突起和错配位于不同位点时所造成的影响有什么区别？

　　在本项研究中，王艳丽课题组及其合作者发现单碱基凸起发生在引导链或者靶链对Ago结构和切割活性的影响不同。研究发现，单碱基凸起如果发生在引导链上（7T8,5A6和4A5）只是在凸起位点引起Ago局部构象的变化，而对于核酸双链的碱基堆积以及对靶链的切割影响很小。但是，如果单碱基凸起发生在靶链的种子区中（6’U7’和6’A7’）能够引起复合物结构明显的构象变化，从而影响对靶链的切割。结合生物化学和结构研究，科研人员发现，单碱基凸起6’N7’对于引导链和靶链的互补稳定性以及切割活性的影响较大。此外，由于引导链的5’末端第一个碱基不与靶链形成互补配对，所以当该位置的碱基发生变化时，对引导链和靶链的互补稳定性以及Ago蛋白的切割活性影响较小。

　　王艳丽研究员是本文的共同通信作者，盛刚高级工程师是本文的第一作者。该项研究得到了国家自然科学基金（项目编号：91440201）以及金沙集团1862cc战略性先导科技专项（B类，项目编号：XDB08010203）的资助，上海同步辐射光源为该研究提供了重要的技术支持。

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图示 TtAgo蛋白引导链（7T8和4A5）单碱基凸起结构图

（供稿：王艳丽课题组）