非编码RNA对生物分子的调控作用，一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中，非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用，调控复杂生物过程。比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及生物分子调控网络的构建是非常重要的。

　　2019年10月31日，Nucleic Acids Research在线发表了中科院生物物理所健康大数据研究中心题目为“NPInter v4.0: An integrated database of ncRNA interactions”的论文，发布了最新版的NPInter（NPInter v4.0)。该数据库系统地收录了绝大多数种类非编码RNA的相互作用，并对相互作用以及相关分子进行了详细的注释以及可视化，提供了一个全面、系统的非编码RNA相互作用的研究平台。

　　陈润生院士课题组于2006年发布了NPInter数据库的第一个版本（Nucleic Acids Research），在过去的十多年中，该数据库一直获得业内的广泛认可，被RNAcentral收录为专家数据库。迄今为止，已经更新过三个版本。此次的v4.0更新，整合了近几年来发表的非编码RNA相互作用文献以及高通量RNA相互作用测序数据，环状RNA（circRNA）的相互作用和ChIRP-seq获得的非编码RNA-基因组的相互作用首次被收录进来。总数据量上升到11万条，涵盖了35个物种。相互作用以及作用分子还增加了疾病注释，旨在帮助研究者更好地理解相互作用的功能。除了整合数据之外，整个数据库的网站也进行了重新构建，提高了原有搜索模块的易用性，并增加了很多新的功能性模块如biocircos.js。网站收录整理了大量具有特定功能的基因集合，并提供了基于这些基因集合的个性化搜索。所有的相互作用数据都可以在（http://bigdata.ibp.ac.cn/npinter4/download/）进行下载。

　　NPInter的此次更新工作主要由金沙集团1862cc健康大数据研究中心(http://bigdata.ibp.ac.cn)完成。该研究中心于2015年5月成立，陈润生院士任中心主任，何顺民研究员任中心常务副主任。中心主要针对生物组学大数据进行整合挖掘分析研究，并辅以开发组学研究分析的新技术，力求打造围绕国家精准医学和重要战略生物资源的组学数据存储、应用和共享的公共技术支撑体系。经过近四年多的运行，中心发展迅速，已完成测序平台、计算集群和数据存储平台、多组学生命数据分析平台和数据共享平台的建设。

　　金沙集团1862cc陈润生院士、何顺民研究员以及金沙集团1862cc计算技术研究所赵屹研究员为本文共同通讯作者。金沙集团1862cc健康大数据研究中心滕学奕、陈晓敏和薛花为本文并列第一作者。该文章获得国家自然科学基金[31701117, 31970647]，国家重点研发项目[2016YFC0901702, 2017YFC0907503]的资助。

　　文章链接：https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz969/5610361?searchresult=1

（供稿：陈润生研究组）