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陈润生研究组联合陈畅研究组
破译枸杞子基因组图谱并揭示其生物活性成分及其合成路径

发布时间:2024年11月05日

  枸杞(Lycium barbarum)作为中国传统的药食同源植物,含有丰富的果胶多糖。枸杞果胶多糖(Lycium barbarum pectin polysaccharides,LBPPs)是枸杞的主要生物活性成分,具有抗氧化、免疫调节、抗衰老等多种功效。尽管枸杞在健康领域应用较多,但由于其缺少精确的遗传图谱,导致LBPPs的合成过程和调控机制研究有限,这在很大程度上制约了枸杞的分子育种发展及国际推广。

  近日,陈润生研究组联合陈畅研究组在《Genomics,Proteomics & Bioinformatics》杂志发表题为"Enzymes Repertoires and Genomic Insights into Lycium Barbarum Pectin Polysaccharides Biosynthesis"的研究论文,解析了枸杞基因组图谱及活性成分。首次揭示了LBPPs的完整生物合成途径,并鉴定了关键合成酶及糖代谢调控相关的RNA。

  该研究基于三代测序技术、光学图谱技术、自研高效三维基因组捕获技术(Trands in Plant Science,2023)等方法,对枸杞进行de novo的基因组组装,突破枸杞基因组高杂合、高重复的瓶颈,获得枸杞高精度基因组图谱。在此基础上,解析了多糖活性酶基因库CAZymes在LBPPs合成中的核心作用,尤其是在枸杞果胶多糖骨架延伸(RRTs)、侧链合成(GAUTs)和链修饰(PAEs)等方面的累积扩张。研究进一步鉴定了一个关键鼠李糖糖基转移酶基因RRT3020,其能够显著促进枸杞果胶多糖的生成。此外,该研究初次解析了与枸杞果胶多糖代谢相关的长链非编码RNA(lncRNAs),为深入了解基因调控提供了新视角。团队首次在枸杞中建立了全面的果胶多糖合成路径,揭示了从糖转运到多糖修饰的整个合成过程(图)。

图. 枸杞中果胶多糖合成和糖转运的示意图

  陈润生院士和陈畅研究员为论文的共同通讯作者,陈润生组岳海燕工程师、唐以恒博士及李艾萱博士为论文的共同第一作者。该研究受到宁夏自治区重点研发计划重大项目、国家重点研发计划、国家自然科学基金的资助。

  文章链接:https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzae079

(供稿:陈润生研究组、陈畅研究组)

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